Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGBD1Q96JS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD1Q96JS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms