Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC16BQ96JE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC16BQ96JE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC16BQ96JE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC16BQ96JE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC16BQ96JE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC16BQ96JE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC16BQ96JE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms