Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PGBD4Q96DM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms