Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3KBP1Q96B97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms