Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL26A1Q96A83 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL26A1Q96A83 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms