Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM239Q8WW34 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM239Q8WW34 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms