Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT2Q8TDY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT2Q8TDY3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms