Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC46■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC45.98■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
RB1CC1Q8TDY2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC45.93■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC45.92■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC45.92■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
RB1CC1Q8TDY2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
RB1CC1Q8TDY2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms