Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL3Q8N8U3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL3Q8N8U3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL3Q8N8U3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms