Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA4Q8IV77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA4Q8IV77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms