Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM139Q8IV31 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms