Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TREML1Q86YW5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms