Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKAP1Q86WV1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKAP1Q86WV1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms