Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
KRT28Q7Z3Y7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT28Q7Z3Y7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT28Q7Z3Y7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms