Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDXQ7Z353 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDXQ7Z353 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms