Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LIAT1Q6ZQX7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIAT1Q6ZQX7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIAT1Q6ZQX7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms