Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMED8Q6PL24 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMED8Q6PL24 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms