Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTLL5Q6EMB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTLL5Q6EMB2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTLL5Q6EMB2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms