Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38BQ5VTL8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF38BQ5VTL8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms