Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
OBSCNQ5VST9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms