Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNYL2Q5T2Q4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNYL2Q5T2Q4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms