Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NHSL1Q5SYE7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NHSL1Q5SYE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NHSL1Q5SYE7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms