Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDYAQ5MJ70 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDYAQ5MJ70 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms