Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COBLL1Q53SF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COBLL1Q53SF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms