Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf17Q53FE4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf17Q53FE4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4orf17Q53FE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms