Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN3Q16667 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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