Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CTF1Q16619 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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CTF1Q16619 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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CTF1Q16619 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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CTF1Q16619 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CTF1Q16619 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTF1Q16619 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTF1Q16619 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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