Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH1Q15438 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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