Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
SHROOM2Q13796 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SHROOM2Q13796 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHROOM2Q13796 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SHROOM2Q13796 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
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