Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CUL4AQ13619 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4AQ13619 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4AQ13619 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4AQ13619 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4AQ13619 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4AQ13619 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4AQ13619 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CUL4AQ13619 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUL4AQ13619 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4AQ13619 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4AQ13619 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4AQ13619 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4AQ13619 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4AQ13619 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CUL4AQ13619 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4AQ13619 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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