Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED1Q13445 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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