Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN4PQ13434 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN4PQ13434 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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