Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KCNH2Q12809 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH2Q12809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH2Q12809 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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