Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP4Q09028 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms