Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL6Q02878 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms