Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F1Q01094 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F1Q01094 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms