Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP2R2BQ00005 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms