Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2C1P98194 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms