Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2IP78347 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2IP78347 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2IP78347 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms