Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK2BP67870 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2BP67870 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK2BP67870 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2BP67870 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2BP67870 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2BP67870 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms