Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOAP61586 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOAP61586 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOAP61586 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOAP61586 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOAP61586 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOAP61586 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOAP61586 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOAP61586 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOAP61586 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOAP61586 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOAP61586 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOAP61586 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOAP61586 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOAP61586 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOAP61586 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOAP61586 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOAP61586 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOAP61586 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOAP61586 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOAP61586 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOAP61586 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOAP61586 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms