Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSE1LP55060 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSE1LP55060 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSE1LP55060 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms