Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN5P54829 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms