Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP13P45452 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP13P45452 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP13P45452 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP13P45452 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP13P45452 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP13P45452 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP13P45452 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP13P45452 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP13P45452 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP13P45452 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP13P45452 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP13P45452 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP13P45452 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP13P45452 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP13P45452 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP13P45452 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP13P45452 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP13P45452 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP13P45452 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP13P45452 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP13P45452 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP13P45452 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP13P45452 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP13P45452 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP13P45452 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP13P45452 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP13P45452 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP13P45452 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP13P45452 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP13P45452 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP13P45452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP13P45452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms