Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNT3P45378 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT3P45378 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms