Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGP37231 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGP37231 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGP37231 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGP37231 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGP37231 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGP37231 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGP37231 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGP37231 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPARGP37231 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPARGP37231 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPARGP37231 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGP37231 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGP37231 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGP37231 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPARGP37231 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGP37231 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGP37231 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPARGP37231 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPARGP37231 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPARGP37231 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGP37231 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPARGP37231 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPARGP37231 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPARGP37231 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms