Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINF1P36955 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms