Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX11P35716 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX11P35716 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX11P35716 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX11P35716 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX11P35716 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX11P35716 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX11P35716 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX11P35716 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX11P35716 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX11P35716 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX11P35716 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX11P35716 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX11P35716 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX11P35716 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX11P35716 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX11P35716 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX11P35716 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX11P35716 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX11P35716 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX11P35716 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX11P35716 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX11P35716 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX11P35716 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX11P35716 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX11P35716 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX11P35716 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX11P35716 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX11P35716 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX11P35716 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX11P35716 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX11P35716 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX11P35716 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX11P35716 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX11P35716 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX11P35716 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX11P35716 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX11P35716 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX11P35716 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX11P35716 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX11P35716 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX11P35716 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX11P35716 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms