Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1L1P21108 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1L1P21108 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms