Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCP20941 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCP20941 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCP20941 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCP20941 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCP20941 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDCP20941 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCP20941 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCP20941 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCP20941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCP20941 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCP20941 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCP20941 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCP20941 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCP20941 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCP20941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCP20941 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCP20941 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCP20941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCP20941 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCP20941 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCP20941 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCP20941 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCP20941 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCP20941 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCP20941 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCP20941 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCP20941 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDCP20941 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDCP20941 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PDCP20941 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCP20941 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCP20941 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCP20941 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCP20941 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCP20941 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCP20941 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCP20941 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCP20941 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCP20941 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCP20941 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCP20941 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCP20941 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCP20941 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCP20941 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCP20941 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDCP20941 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms